清初，马姓迁来后首先在在此搭庵建庄，故名。
马庵村是方城县独树镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为411322101213，居民身份证号码前6位为411322。邮政编码为473000，长途电话区号为377 ，车牌号码为豫R。马庵村与孙洼村、吴井村、韩庄村、周庄村、板井村、独东村、姚庄村、三里堡村、栗园村、独西村、张寨村、独北村、陈庄村、朱沟村相邻。历史沿革：清属裕州抚老下里。
1958年成立马庵大队，属独树公社。
1970年并入吴井大队属独树公社。
1978年分开仍为马庵大队属独树公社。
1984年改队为马庵村民委员会后，属独树乡。
1986年改置镇后，属独树镇马庵村民委员会。
