清初，吴姓迁来定居后打井一眼，故名。
吴井村是方城县独树镇下辖的行政村，城乡分类代码为122，为镇乡结合区。区划代码为411322101212，居民身份证号码前6位为411322。邮政编码为473000，长途电话区号为377 ，车牌号码为豫R。吴井村与马庵村、周庄村、孙洼村、板井村、姚庄村、韩庄村、栗园村、独东村、张寨村、三里堡村、朱沟村、独西村、康店村、独北村相邻。历史沿革：清属裕州抚老下里。
1958年成立吴井大队，属独树公社。
1961年至1969年属独树区。
1970年马庵大队并入为吴井大队，属独树公社。
1979年马庵大队分出仍为吴井大队属独树公社。
1984年改队为吴井村民委员会后，属独树乡。
1986年改置镇后，属独树镇吴井村民委员会。
