清代，朱姓建庄于山下谷内，故名。
朱沟村是方城县独树镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为411322101206，居民身份证号码前6位为411322。邮政编码为473000，长途电话区号为377 ，车牌号码为豫R。朱沟村与康店村、张寨村、常庄村、栗园村、招西村、姚庄村、板井村、招东村、周庄村、平原村、竹园村、吴井村、马庵村、孙洼村相邻。历史沿革：清属裕州抚老上里。
1949年鲁南县撤消后，属方城县杨集区。
1961年成立常庄大队，属独树区招抚岗小公社。
1969年由常庄大队分出为朱沟大队属独树公社。
1984年改队为朱沟村民委员会后，属独树乡。
1986年改置镇后，属独树镇。
