清代时期,有马姓人迁此深沟内定居,故名马沟。
马沟村位于新郑市辛店镇西南部,全村共有12个村民组,489户,1876口人。耕地面积2180亩,其中有退耕还林1230亩,现有党员53人。全村以种植业、建材业为经济发展的主要支柱。马沟村与仰望坡村、裴商庙村、王庄村、湛张村、黄岗村、靳沟村、后高庄村、化雨庄村、齐河村、刘湾村、岳庄村、北靳楼村、贾岗村、贾咀村相邻。历史沿革:1948年11月,归辛店区(第三区)。
1955年12月,归山陈中心乡。
1958年8月,组建老龙窝大队,归辛店公社。
1965年,老龙窝大队更名为马沟大队。
1983年,撤销马沟大队,选举产生马沟村民委员会,归千户寨乡。
2005年11月,归辛店镇,沿用至今。