2017年全国高校第四轮学科评估，生物医学工程专业东南大学、华中科技大学评为A+学科。上海交通大学评为A学科。
| 学科代码 | 一级学科名称 | 学校代码 | 学校名称 | 评估结果 |
| 0831 | 生物医学工程 | 10286 | 东南大学 | A+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10487 | 华中科技大学 | A+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10248 | 上海交通大学 | A |
| 0831 | 生物医学工程 | 10003 | 清华大学 | A- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10006 | 北京航空航天大学 | A- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10335 | 浙江大学 | A- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10610 | 四川大学 | A- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10001 | 北京大学 | B+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10056 | 天津大学 | B+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10246 | 复旦大学 | B+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10561 | 华南理工大学 | B+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10611 | 重庆大学 | B+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10614 | 电子科技大学 | B+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10698 | 西安交通大学 | B+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10005 | 北京工业大学 | B |
| 0831 | 生物医学工程 | 10007 | 北京理工大学 | B |
| 0831 | 生物医学工程 | 10213 | 哈尔滨工业大学 | B |
| 0831 | 生物医学工程 | 10252 | 上海理工大学 | B |
| 0831 | 生物医学工程 | 10590 | 深圳大学 | B |
| 0831 | 生物医学工程 | 12121 | 南方医科大学 | B |
| 0831 | 生物医学工程 | 90032 | 第四军医大学 | B |
| 0831 | 生物医学工程 | 10025 | 首都医科大学 | B- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10141 | 大连理工大学 | B- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10145 | 东北大学 | B- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10226 | 哈尔滨医科大学 | B- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10247 | 同济大学 | B- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10358 | 中国科学技术大学 | B- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10558 | 中山大学 | B- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10559 | 暨南大学 | B- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10062 | 天津医科大学 | C+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10284 | 南京大学 | C+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10343 | 温州医科大学 | C+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10422 | 山东大学 | C+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10699 | 西北工业大学 | C+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10701 | 西安电子科技大学 | C+ |
| 0831 | 生物医学工程 | 10112 | 太原理工大学 | C |
| 0831 | 生物医学工程 | 10285 | 苏州大学 | C |
| 0831 | 生物医学工程 | 10384 | 厦门大学 | C |
| 0831 | 生物医学工程 | 10486 | 武汉大学 | C |
| 0831 | 生物医学工程 | 10613 | 西南交通大学 | C |
| 0831 | 生物医学工程 | 11535 | 湖南工业大学 | C |
| 0831 | 生物医学工程 | 90002 | 国防科技大学 | C |
| 0831 | 生物医学工程 | 10013 | 北京邮电大学 | C- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10080 | 河北工业大学 | C- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10183 | 吉林大学 | C- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10186 | 长春理工大学 | C- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10217 | 哈尔滨工程大学 | C- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10255 | 东华大学 | C- |
| 0831 | 生物医学工程 | 10287 | 南京航空航天大学 | C- |
