因居民住地村西、村南渭谷陡地，使人望之目眩，而得眩头，后演化为玄头村。

玄头村是清水县山门镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为620521105211，居民身份证号码前6位为620521。邮政编码为741000，长途电话区号为938 ，车牌号码为甘E。玄头村与白河村、腰套村、关山村、旺兴村、吊山村、大集村、白树村、高桥村、史沟村、山门社区、观音殿村、什字村、南山村、刘崖村相邻。历史沿革：1949年隶属于天水县元龙区；1954年为清水县旺兴乡玄头村；1958年隶属于山门公社旺兴管理区；1961年为旺兴公社玄头大队；1983年为旺兴乡玄头村；2004年将原草滩村并入玄头村，更名为山门镇玄头村民委员会至今。

民国时期为保甲制，1949年初为玄头村人民代表大会，1955年至1958年为玄头农业合作社，1958年至1980年为玄头生产大队，1983年至今为玄头村村民委员会。