明末清初，部分逃荒难民在此建庄，因地高田多，起名高田。后因村处毛泌古道，过往商人较多，即建店铺供人食宿，更名高店。

高店村位于黄岗镇西4公里处，全村总面积8.5平方公里，耕地面积2639亩，总户数409户，总人口1760人。下辖11个村民小组，14个自然村庄。高店村位于桐柏县与泌阳交界处，基础设施薄弱，土地面积少，人口多，经济发展比较落后，阻碍了当地经济发展。经济发展上高店村主要以花生、桃树、艾叶为主导种植产业。高店村与枣树岗村、刘老庄村、岳新庄村、刘庄村、黄岗村、王庄村、核桃树村、大石桥村、黄楼村、斗称沟村、大棚村、段庄村、光荣庄村相邻。历史沿革：1949年前属毛集区光武乡李楼保。

1958年称高店大队，属黄岗公社。

1983年撤社设乡，更名高店村民委员会，属黄岗乡。

2007年撤乡建镇属黄岗镇至今。