因在洪武年间有一位姓陈的人迁移到大沟旁而得名。
2021年12月，陈沟村被命名为2021年度淮安市卫生村。
陈沟村：位于灰墩村西北4公里处。陈沟村与墩南村、大胡村、天鹅荡村、南园村、北尹荡村、灰墩村、高西村、戴洼村、丁庙村、金郑村、苗荡村、扁担村、周码村、新农村相邻。历史沿革：1958年成立陈沟大队，1983年改为陈沟村，成立陈沟村村民委员会，一直沿用至今。
