因早先此地居住瓦氏家族，形成了聚居。而在聚居地内有一处寺庙，该寺庙为瓦氏家族的氏族宗庙，得名瓦家寺，故名。
瓦家寺村是临洮县窑店镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为621124108204，居民身份证号码前6位为621124。邮政编码为743000，长途电话区号为932 ，车牌号码为甘J。瓦家寺村与徐家铺村、窑店村、黄家川村、杨家山村、武家村、长城村、阳坡村、大坊村、马家坪村、四十铺村、中间村、北大坪村、平线岭村、翻山村相邻。历史沿革：1944年起为窑店乡瓦家寺村。
1963年属于红霞人民公社团结大队。
1969年后历属窑店人民公社。
2001年撤乡建镇后属于窑店镇至今。
