因境内有寺庙一座，取名高庙，村名遂借取庙名为名，故名。

2020年4月原高庙子村和长沟村合并成立高庙子村，办公地点设在原高庙子村办公室。原高庙子村全村总户数338户，总人口1148人。耕地总面积1040亩，其中田404亩，土636亩。全村党员23人，其中女党员2名。全村低保人口41人，贫困户31户78人，五保11人，残疾人39人。原长沟村全村总户数393户，总人口1391人。耕地总面积1391亩，其中田475亩，土916亩。全村党员31人，其中女党员4名。全村低保人口50人，贫困户32户71人，农业以水稻、小麦、玉米、油菜为主，养殖业以养猪、养鸡、鸭、鱼为主。高庙子村与玉峰山村、河西社区、天宫堂村、普明寺村、万德沟村、毛家坪村、宝堂寺村、桂花社区、和兴社区、龟山寺村、曹家庙村、朝阳店村、长埝沟村、河东社区相邻。荣誉排行：

2019年12月，高庙子村入选2019年四川省卫生村（社区）名单。

历史沿革：1951年为长庚村，1958年改为9大队，1981年地名普查时更名为高庙子大队，1984年改大队为村，2020年5月村级建制调整，地名沿用。