南宋末年，东莞常平板石有部分梁姓居民迁移到深沥建房定居，村庄建在沙河南岸边分流一条大沥，故名深沥村。

2026年1月，获评广东省第二批“百千万工程”典型村称号。

2022年10月，2022年淘宝村名单发布，深沥村上榜。

2021年10月，南京大学空间规划研究中心、阿里研究院联合发布2021年淘宝村名单，深沥村榜上有名。

2020年9月，阿里研究院公布2020年淘宝村，深沥村榜上有名。

深沥村是博罗县园洲镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为441322119207，居民身份证号码前6位为441322。邮政编码为516000，长途电话区号为752 ，车牌号码为粤L。深沥村与土瓜圩村、沙头村、禾山村、阵村村、廖尾村、刘屋村、下南村、桔龙村、田头村、江头村、马嘶村、白耀前村、高头村、九潭社区相邻。历史沿革：新中国成立前，深沥村隶属东莞县文顺乡（现石龙）。

1952年，深沥村与土瓜圩、沙头、阵村合并为丰平乡，隶属东莞县第七区（企石区）。

1958年隶属于东莞县企石公社上南大乡。

1959年，隶属博罗县园洲人民公社。

同年，深沥村与土瓜圩村合并为土深大队。

1983年，深沥与土瓜圩合并为土深乡，隶属园洲区。

1986年，从土深乡分出，成立深沥管理区。

1999年称深沥村民委员会至今。