因位于庙底的南边一山沟口内，故得名南沟。
南沟村是新安县石井镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为410323109225，居民身份证号码前6位为410323。邮政编码为471000，长途电话区号为379 ，车牌号码为豫C。南沟村与龙山社区、西岭村、山头岭村、前口村、南腰村、莲花村、杨家庄村、胡庄村、潭上村、东山底村、峪里村、黑扒村、五顷村、香头庙村相邻。历史沿革：11951年7月属石井区。
1958年南沟生产大队属石井公社。
1969年南沟生产大队划属峪里管辖。
1984年南沟村民委员会属峪里乡。
2005年峪里乡并入石井乡，南沟村民委员会属石井乡。
2010年经省政府批准石井乡撤乡建镇，南沟村民委员会属石井镇至今。
