清乾隆年间，“厝上”曾名“港据”，因村落建于海港高地上，繁华喧闹，绿树掩映，庭院楼阁犹如繁花锦簇竞相辉，故又有“锦上”、“锦尚”之美称。后因从港畔仰望，红砖房舍井然有序地建于万顷碧波之上，于是改称“厝上”。

由前后厝（一中）、后申厝（二中）、北长厝（三中）、前美厝（四中）、斗文房和大墩（五中）共5个角落组成。相传，宋元时期有陈氏、张氏聚居于此，因村落建于海港高地，取名“港据”，又名“厝上”，雅称“锦尚”或“锦上”，名载道光《晋江县志·铺递志》。清代《金丘邱氏族谱》记载，元末世乱，邱国源兄弟四人避居于海滨。长邱国源，入居邱下。次邱国寿，“籍海东港据，今厝上始祖也”。相传，厝上邱氏始祖以养鸭为生，其开基地后称为“鸭母穴”。三邱国梅，迁往“南京应天府”。四邱某（名讳失传），移居天马山（金鞍山）之东。厝上溪 源自奈清水库，流经青莲、奈厝前、墩上、上埭、西港并环厝上之南汇流入海。下游+查看详细厝上村概况>>

2021年11月，福建省爱卫办命名厝上村为2021年福建省卫生村。

历史沿革：宋朝时期属安仁乡永宁里；明、清时期属二十都；民国33年（1944年）属永宁厝上保；解放初期属晋江县第九区（永宁）厝上乡；1955年属双湖区，东店、杨厝、后山、西港等11个自然村组成厝上乡；1958年属祥芝锦星大队；1961年为便于领导分为厝上农业和厝上渔业大队，后改为村委会。

厝上自然村原设厝农、厝渔建制村，在1994年改为厝上村与锦尚村。