明代，村内曾建有祖师爷庙，村以庙名，故名。
祖师庙村是新蔡县顿岗乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为411729207201，居民身份证号码前6位为411729。邮政编码为463000，长途电话区号为396 ，车牌号码为豫Q。祖师庙村与下丕岗村、双庄村、桂营村、班台村、黄冢庙村、吴湾村、苏湾村、平楼村、陈港村、支湾村、赵庄村、焦庄村、土楼村、马庄村相邻。历史沿革：1951年属新蔡县八区（涧头）。
1958年成立下丕岗生产大队，属灯塔人民公社。
1980年从下丕岗生产大队分出祖师庙、闫楼、管庄三个自然村，成立祖师庙生产大队。
1983年改称祖师庙村民委员会，属顿岗乡。
