明代，由太康县西南张庄迁来张姓在此开盐店，由孙店南虹河沿章庄迁来章姓，由秣陵镇西北迁来臧姓，三家共居一村，故名。
2021年1月，河南省爱卫会命名三店村为2020年度河南省卫生村。
三店村是项城市三店镇下辖的行政村，城乡分类代码为121，为镇中心区。区划代码为411681113200，居民身份证号码前6位为411681。邮政编码为466000，长途电话区号为394 ，车牌号码为豫P。三店村与大丁村、新寨村、张寨村、李庄村、坡龚村、田集村、纪韩村、绰刘村、夏寨村、陈张村、杨楼村、盛营村、黄庄村、夏庄村相邻。历史沿革：1949年属项城县第八区。
1958年9月为韩李寨公社三张店生产大队。
1965年7月为三张店公社三张店生产大队。
1983年12月为三张店乡三张店村民委员会。
2011年12月三张店撤乡设镇，为三店镇三张店村民委员会至今。
