王姓于明嘉靖二十一年（1542）自山西大槐树迁此沟，见沟内冲积形成很多石磙，遂以村名。
磙子沟村是淅川县厚坡镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为411326104212，居民身份证号码前6位为411326。邮政编码为473000，长途电话区号为377 ，车牌号码为豫R。磙子沟村与严营村、胡湾村、张寨村、王沟村、王寨村、王岗村、王营村、陈营村、马庄村、齐湾村、后寨村、岗西村、蒋营村、刘营村相邻。历史沿革：1914年属北三区梁庄里。
1943年属邓县彭桥区梁庄乡。
1958年建磙子沟大队，属邓县杨窝公社。
1984年改为磙子沟村民委员会，属厚坡乡。
1994年改镇，属厚坡镇至今。
