名“瓷窑”，后改名“磁窑”。建村于宋朝，距今约有七百多年的历史。先是姓曾的人来开基，后姓孟的人也来此开基立业，建造瓷窑，生产瓷器。开祖于宋代，因祖辈烧窑，故瓷窑在本地区盛名，称为磁窑村，故名。

杏陈镇磁窑村位于东山岛西北部，离东山八尺门大桥约2公里，全村有169户，约710人，分三个村民小组。设一个党支部，有党员37名，辖区总面积约1080公顷，其中耕地面积361亩，海地（含滩涂）约250亩，种植业发展较杂，有芦笋、水果、粮食等。海水养殖有泥蚶、龙须及虾和青蟹，大部分村民以外出打工为生，全村约有二百多人从事务工行业，去年村民的人均纯收入5432元，增长12%，村后有宋代瓷窑遗址，被东山县政府列为二级保护单位。磁窑村与张家村、高陈村、埕英村、礁头村、前何村、径口村、大山产村、后林村、埔头村相邻。荣誉排行：

2024年2月，磁窑村被确定为第二批福建省乡村振兴示范村镇创建对象。

2021年12月，磁窑村被确定为福建省第二批高级版绿盈乡村（乡镇）。

2021年11月，福建省爱卫办命名磁窑村为2021年福建省卫生村。

2021年6月，福建省第四批省级传统村落名单出炉，磁窑村榜上有名。

历史沿革：建国后属三区；1958年属杏陈公社磁窑大队；1984年设立杏陈乡磁窑村；1990年属杏陈镇磁窑村。