该地位于九十九溪南岸的地势较为低洼处，因九十九溪一支流经村西北流入溪，村前有一引溪水灌溉之水圳，水流常年清澈见底，故旧称为清浚。后因方言谐音而演化为深圳。村委会以驻地自然村深圳得名。

深圳村始名清浚。因村前有一条水圳，长年水清澈透底而得名，后因闽南语谐音得名深圳。深圳村始于明末年间，原属泉州府南门外四都，建国后隶属安海镇天亮乡，1960年建制深圳大队，1964年与白垵合并为天亮大队，1984年12月由天亮大队拆出自成深圳村委会，隶属内坑镇。深圳村位于福建省泉州晋江市内坑镇政府驻地西北三公里。东至在建福厦铁路泉州南站物流区，西邻白垵、湖内村，南与潘厝、石湖潭毗连，北与吕厝隔晋江九十九溪相望。 土地面积为2.27平方公里，辖深圳、内林、井上三个自然村，十四个生产小组，村落总1021户、人口为4256人，是内坑镇人口第一大村，村委会设于深圳。村设党总支部委+查看详细深圳村概况>>

2022年12月，福建省爱国卫生运动委员会命名深圳村为2022年福建省卫生村。

2021年6月，被命名为2020年度晋江市平安村（社区）(四星级)。

历史沿革：宋为开建乡务本里管辖。

民国33年（1944年属亲民乡祥安保。

建国后，1956年属内坑区天亮乡，1961年属内坑公社深圳大队；1964年属内坑公社与白垵合并为天亮大队，1984年12月属内坑乡由天亮大队拆出自成深圳村委会；1992年改为内坑镇深圳村委会。