驻地村以旧时余氏在此开基定居而得名。

余元村位于开善乡东北部，距乡政府所在地4公里，全村共有耕地面积546亩，山林面积1.2万亩；下辖余源、布元、邹家塅3个自然村，5个村民小组，共有80户，328人，党员18名，常年外出务工116人。2009年，农民人均收入达5915元，村财收入达15万元。 2006年被确定为全县第一批新农村建设整治村以来，通过大力实施“五双”工程，发挥“八个方面作用”，村党支部凝集力和战斗力有效增强，村容村貌明显改善，主要有以下几个特点：一是人居生态村。村两委结合“省级生态村”创建工作，全力推进村庄整治和生态环境保护工作。全村绿化总面积1.25万亩。其中，村所在地公共绿地面积1000余平方米，村+查看详细余元村概况>>

2024年7月，被命名为2023年度三明市达标“六无”村（社区）。

2024年7月，被确定为2021-2023年三明市达标“六无”村（社区）。

2024年1月，余元村被命名为2023年福建省卫生村。

2017年11月，中央文明委决定授予余元村第五届全国文明村镇称号。

历史沿革：宋代至清代属崇礼乡高平里开善上保；民国初至1931年属于南乡；1931年至1934年苏维埃时期隶属于大均区；1934年6月隶属三区，1940年属开永乡；解放后1950年12月至1951年12月，成立余上乡政府（即今余上、余源两村），隶属三区；1956年并入余坊乡，隶属弋口区；1958年从余坊分出成立余上生产大队，隶属冲天公社；1959年隶属儒坊公社（因儒与余本地方言同音，后写为余坊），1960年从+查看详细余元村历史沿革>>