因村中有一小溪名为“石郑溪”而得名。早年因石郑溪溪水清澈也叫“清溪”。设立村民委员会后，即“石郑村村民委员会”。

2021年11月，福建省爱卫办命名石郑村为2021年福建省卫生村。

石郑村是闽清县梅溪镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为350124101207，居民身份证号码前6位为350124。邮政编码为350000，长途电话区号为591 ，车牌号码为闽A。石郑村与马洋村、樟洋村、北溪村、渡口村、里寨村、榕星村、建兴村、钟石村、新民村、榕院村、梅埔村、上埔村、石湖村、新城社区相邻。历史沿革：民国28年（1939年）9月以前隶属闽侯县小樟乡。

同年10月移划闽清县属第一区小樟乡的樟马保。

1958年设石郑大队属英雄人民公社。

1984年7月，撤销公社建制，设石郑村委会属梅溪乡人民政府。

1993年撤乡建镇后，属梅溪镇人民政府。