当地《张氏宗谱》载，明崇祯年间(1628-1644)，玛瑚渡上下端各有商店一间，分别称上店，下店，本村位于上端，即以上店为村名。
上店村基本概况上店村位于水头镇西部，行政面积700亩，耕地面积120亩，水田40亩，林地面积270亩，旱地面积80亩，户籍人口1182人，共计354户，党员22名，妇女党员4人，村民代表53人，低保31人，村里60岁以上老上159人，外来人口6300人，出租房87家。现经济收入主要来源为农业和在邻村皮革厂务工（如皮革加工，生厂皮带等）上店村与仕静社区、外岙村、水凤尾村、蒲潭村、腾龙社区、金凤社区、乐溪社区、金山垟社区、三桥社区、詹家埠社区、鸣溪村、内岙村、蔡垟村、溪尾村相邻。历史沿革：解放初为水头镇上店村。
1956年由龙涵、上店、麻园3个自然村合并组成上店高级社，属水头镇。
1958年称溪心大队（管理区）上店生产队。
1961年为溪心公社上店大队。
1984年称上店村委会，属溪心乡。
1992年随溪心乡并入水头镇。
