因座落于琚村西南方向的一条沟内而得名。因该村为村委会驻地，故名。

2023年11月，山西省爱国卫生运动委员会命名西南沟村为2023-2025年山西省卫生村。

2020年8月，山西省爱国卫生运动委员会命名西南沟村为2020—2022周期山西省卫生村。

西南沟村是长子县色头镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为140428105212，居民身份证号码前6位为140428。邮政编码为046000，长途电话区号为355 ，车牌号码为晋D。西南沟村与柳叶沟村、琚村村、和平新村、王晃村、色头村、西后沟村、河峪村、小琚村、东南沟村、平西沟村、赵家庄村、地河村、庄里村、鲍寨村相邻。历史沿革：1945年属长子县三区管辖。

2000年撤乡并镇后，属于色头镇管辖。

该地名自使用以来一直沿用至今。