传一吕姓人家在此开旅店，往来于伊川、偃师两地做生意的客商常歇脚食宿于该旅店，后来人口不断集聚形成村落，故称为吕店。
吕店乡位于伊川县东北部，距伊川县城20余公里。东邻江左乡，西接彭婆镇，南与白沙乡接壤，北与偃师市寇店镇毗邻。面积124平方公里，耕地面积5934公顷。辖38个行政村，87个自然村，324个村民组。全乡5.78万人，其中非农业人口1047人。乡政府驻吕店村东部。荣誉排行：
2022年3月，吕店镇被命名为2021年度河南省卫生乡镇。
温氏宅院温氏宅院类别：古建筑时代：清地址：伊川县吕店乡温沟村公布时间：2008/6/1公布批次：第五批温沟村位于伊川县城以东的吕店镇，大约行半小时路程即到，村里现存的古宅有4座，为“四合院”式建筑，白区地下活动办公室旧址白区地下活动办公室旧址类别：近现代重要史迹及代表性建筑时代：1937年地址：伊川县吕店镇周沟村历史沿革：1932年设吕店区。
1984年社改乡，由吕店人民公社改为吕店乡。
2010年撤乡设镇，由吕店乡改名为吕店镇，至今。
