明末清初有一举人落难至此，当地群众鼎力相救，后为谢恩，办学育人，并修建文庙、下庙、龙王庙三庙。因庙宇高耸，登台可观四方，后人以庙命村故称高庙。

2022年10月，高庙村被列入第六批中国传统村落。

2020年8月，高庙村入选第二批全国乡村旅游重点村名单。

2020年3月，甘肃省爱国卫生运动委员会命名高庙村为2019年度甘肃省卫生村（社区）。

高庙村入选甘肃省第六批“全省民主法治示范村（社区）”名单。

高庙村是山丹县李桥乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为620725204202，居民身份证号码前6位为620725。邮政编码为734000，长途电话区号为936 ，车牌号码为甘G。高庙村与吴宁村、杨坝村、巴寨村、河湾村、下寨村、上寨村、周庄村、东沟村、西沟村相邻。历史沿革：1954年成立初级农业合作社，1956年改为高级农业合作社，1958年成立人民公社，高庙属于李桥公社，1958年改名为高庙大队。

十一届三中全会后，改村名为高庙村村民委员会。