寨子背后的山上有一块形似大旗的岩石而得名。
旗山村是独山县百泉镇下辖的行政村,城乡分类代码为220,为村庄。区划代码为522726108222,居民身份证号码前6位为522726。邮政编码为558000,长途电话区号为854 ,车牌号码为贵J。旗山村与尧梭村、凤汝村、百泉湖村、朵罗村、大河村、羊凤村、巴台村、摆罗村、望城社区、里腊村相邻。历史沿革:1963年属城关区新民公社。
2007年龙山村、中和村、旗山村合并为旗山村,属城关镇。
2014年9月由新力村、其山村、摆独村合并为旗山村,属百泉镇至今。