因辖区内有主干道木棉路穿过，故名。
2019年9月，木棉树社区上榜2018年广东省“民主法治示范村（社区）”创建单位名单。
木棉树社区是徐闻县徐城街道下辖的社区，城乡分类代码为121，为镇中心区。区划代码为440825001002，居民身份证号码前6位为440825。邮政编码为524000，长途电话区号为759 ，车牌号码为粤G。木棉树社区与向阳社区、龙尾社区、南门塘社区、华建社区、大糖社区、附城社区、何宅寮村、西门村、北门村相邻。历史沿革：1950年设立木棉树居委会；1966年文革期间改为工农兵居委会；1977年改为木棉树社区居民委员会，一直沿用至今。
