清代建庙，内供南海观世音菩萨，取名南施寺，后误称南山寺。村依境“南山寺”，而得名。神童港村：港畔有后稷宫。《史记》载：稷“儿时，好种麻菽，麻菽美”，人称神童。民国时此处有汤姓一孩童甚聪，故名神童，又称神童港。村依驻地命名。

2023年2月，南山村综合文化服务中心被确定为2022年“最美潇湘文化阵地”。

2021年2月，司法部、民政部公布南山村为第八批全国民主法治示范村（社区）。

2019年12月，国家林业和草原局公布第二批国家森林乡村名单，南山村榜上有名。

2018年，南山村被命名为第八批湖南省民主法治示范村（社区）。

南山村是南县南洲镇下辖的行政村，城乡分类代码为122，为镇乡结合区。区划代码为430921125210，居民身份证号码前6位为430921。邮政编码为413200，长途电话区号为737 ，车牌号码为湘H。南山村与南洲村、班嘴村、小荷堰村、洗马湖村、新荷社区、育才村、火箭社区、清水堰村、青鱼村、宝塔湖社区、新张村、花甲湖社区、长胜村、东红社区相邻。文化旅游：

南山村遗址南山村遗址位于南洲镇南山村17组，年代为新石器时代。为南县第四批县级文物保护单位。保护范围：向南15米、向北15米、向东15米、向西15米。建设控制地带：向南15米、向北15米、向东15米、历史沿革：围湖建垸时期为南施洲；1961年调整公社体制为育才公社南山大队；1969年区划调整，原育才公社析设为九都山公社、荷花公社，为九都山公社南山大队；1984年政社分设为九都山乡南山村，下设二十个村民小组；2004年综撤并乡镇，南山村划至南洲镇，仍为南山村；2016年南山村、神童港村合并称南山村。