明弘治年间，孙姓来祖由山西洪洞迁此，以姓氏定村名为孙庄。清末，有富户养水牛12头，外人叫为水牛孙庄。1949年以后，因村北地势较洼，大雨过后一片汪洋，村民以叫水牛孙庄不雅，便改村名孙洼。
2022年1月，孙洼村被命名定为2021年度河南省卫生村。
孙洼村是沈丘县纸店镇下辖的行政村，城乡分类代码为121，为镇中心区。区划代码为411624106211，居民身份证号码前6位为411624。邮政编码为466000，长途电话区号为394 ，车牌号码为豫P。孙洼村与王庄村、卢庄村、秦庄村、潘董庄村、邱庄村、张庄村、杂姓营村、小李庄村、程营村、潘营村、胡营村、徐楼村、白果村、赵楼村相邻。历史沿革：1958年设孙洼生产大队，属纸店人民公社。
1983年改设孙洼村民委员会，属纸店乡。
