明中期，李姓从山西洪洞县迁此定居，并在村西建一座庙，庙内塑立玉皇大帝神像，故名玉帝庙。
玉帝庙村是沈丘县付井镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为411624105212，居民身份证号码前6位为411624。邮政编码为466000，长途电话区号为394 ，车牌号码为豫P。玉帝庙村与岗王村、梅庙村、卜楼村、周寨村、洼李庄村、东李楼村、周庄村、宿营村、孙小楼村、腰庄村、赵庙村、马堂村、西李楼村、高湖村相邻。历史沿革：1958年设立玉帝庙生产大队属付井人民公社。
1983年改为玉帝庙村民委员会属付井乡。
1987年10月撤乡建镇属付井镇。
1989年玉帝庙生产大队分成玉帝庙和梅庙两个村民委员会，属付井镇至今。
