清道光年间，湖北郑姓迁此建村，因当时所处山沟，林木繁盛，出产木耳，因此得名郑家木耳沟，后讹名为郑家磨沟。

磨沟村位于新集乡政府南端5公里处，地属深山区，整体地势属东高西低。全村下辖5个村民小组，7个自然村，有小型三类水库2座。全村总人口978人，总户数262户，全村耕地面积932亩，森林面积6000亩，全村村民以种植夏枯球、桅子、木瓜、水稻等作物为支柱产业，农闲时以外出务工为第二收入，在村辖区内没有矿产资源，村部4间二层，小学教学楼4间二层。磨沟村与杨湾村、栗园村、洛河村、王寨村、徐庄村、苏庄村、王楼村、梁庄村、张盖村、新集村相邻。荣誉排行：

2025年3月，被命名为第七届全国文明村镇。

2023年9月，磨沟村被确定为河南省第一批乡村建设示范村。

2022年12月，被认定为河南首批乡村康养旅游示范村。

2022年1月，河南省农业农村厅认定磨沟村为河南省首批省级一村一品示范村镇（特色产品：乡村旅游）。

2021年9月，磨沟村被认定为第二批全国乡村治理示范村。

2019年12月，国家林业和草原局公布第二批国家森林乡村名单，磨沟村榜上有名。

历史沿革：清、民国时期属七里岗保。

1958年成立人民公社，称磨沟大队，属程湾公社。

1983年撤社设乡，更名磨沟村民委员会，属新集乡至今。