清代年间，姓吴的人家在此安家居住，后来段姓、尹姓迁入，形成村落。因吴姓先居此处，村中多沟，故取名吴沟。
吴沟村是伊川县江左镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为410329105231，居民身份证号码前6位为410329。邮政编码为471000，长途电话区号为379 ，车牌号码为豫C。吴沟村与李寨村、白村村、贾村村、武寨村、张窑村、段村村、杨沟村、官庄村、王窑村、塔沟村、上王村、魏村村、杨窑村、相寨村相邻。历史沿革：1948年属江左区。
1958年成立吴沟生产大队，属江左人民公社。
1984年改设吴沟村民委员会，属江左乡。
2009年10月撤乡建镇，属江左镇。
