根据《马沟村志》记载，现岳村西马庄马姓第八世祖马大强，于明万历年间（1550-1580）从密东马庄迁居（今马沟街），距今460年，马姓发展壮大，马姓居多，故称马沟。因村民委员会位于此村，故得名马沟村民委员会。

2023年9月，马沟村被确定为河南省第一批乡村建设示范村。

马沟村是新密市来集镇下辖的行政村，城乡分类代码为122，为镇乡结合区。区划代码为410183110221，居民身份证号码前6位为410183。邮政编码为450000，长途电话区号为371 ，车牌号码为豫A。马沟村与巩楼村、东于沟村、苏寨村、马武寨村、桧树亭村、翟坡村、岳岗村、陈沟村、李堂村、宋楼村、韩家门村、赵沟村、来集村、王家窝村相邻。历史沿革：1948年属浮山乡。

1963年属来集公社马沟大队。

1983年来集公社改来集乡，撤马沟大队选举产生马沟村民委员会，属来集乡马沟村民委员会。

1995年来集撤乡建镇，属于来集镇马沟村民委员会，沿用至今。