明朝前期，陈氏德莱公自遂义里漈头村迁至，有凤翔境。原村置围垦海堤的一闸门（俗称斗门）之西北，故别名斗门头。西边原为海口镇东卫城，垣城池释故合之为斗垣至今。

2024年2月，斗垣村被确定为第二批福建省乡村振兴示范村镇创建对象。

2021年11月，福建省爱卫办命名斗垣村为2021年福建省卫生村。

斗垣村是福清市海口镇下辖的行政村，城乡分类代码为122，为镇乡结合区。区划代码为350181103213，居民身份证号码前6位为350181。邮政编码为350300，长途电话区号为591，车牌号码为闽A。斗垣村与城里村、海口村、前村村、后路村、晨光村、牛宅村、云光村、立新村、海口社区、东峤村、东岐村、梧屿村、李厝村、南厝村相邻。文化旅游：

福清市斗垣村革命烈士纪念室福清市斗垣村革命烈士纪念室位于福清市海口镇斗垣村程序故居内。1932年1月，龙高暴-动-的-声刚刚响过，中共福州市委就派黄孝敏来到福清，总结龙高暴-动-经-验教训，为开展新的斗争做准备。余长历史沿革：宋属感德乡新安里。

清宣统二年（1910年）属海口镇。

1943年为斗垣保驻地，分8甲，属海口镇。

1958年9月属海口公社城里大队。

1961年析出，成立斗垣大队，仍属海口公社。

1984年改公社为镇，大队为村委会，亦随之。