《东山志》云：“牟山，山形似牟，其地为兰风，有牟山港，牟山庙。”因境内有牟山，故以山得名，故名。

2021年12月，牟山村被命名为2021年浙江省卫生村。

2020年12月，牟山村被命名为浙江省2020年度“省级民主法治村（社区）”。

牟山村是余姚市牟山镇下辖的行政村，城乡分类代码为121，为镇中心区。区划代码为330281108200，居民身份证号码前6位为330281。邮政编码为315000，长途电话区号为574 ，车牌号码为浙B。牟山村与魏家村、牟山镇社区、狮山村、青港村、湖山村、牟山湖村、新东吴村相邻。历史沿革：1949年初为牟山乡四、五、六、七、八保，1950年为牟山乡一、二、三、四村、青港乡一村，1956年建立胜利、勤丰高级社，1961年为牟山公社胜利、孙家大队，1981年为牟山、孙村大队，1983年改称牟山乡牟山、孙村村民委员会，1991年牟山乡改为牟山镇。

2001年由孙村、牟山村两村合并为牟山镇牟山村村民委员会。