山沟里曾有过烧制瓦砖的窑场，故称瓦窑沟；根据其所在居民点（瓦窑沟）得名。村民委员会驻地。

2023年11月，山西省爱国卫生运动委员会命名瓦窑沟村为2023-2025年山西省卫生村。

瓦窑沟村是应县南泉乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为140622206207，居民身份证号码前6位为140622。邮政编码为036000，长途电话区号为349 ，车牌号码为晋F。瓦窑沟村与窨子沟村、西贾庄村、东贾庄村、小山门村、西窑村、下贾庄村、南上寨村、周家地村、钗里村、教场村、南泉村、观口前村、清凉庄村、土巷村相邻。历史沿革：1949-1953年属应县四区；1955年成立瓦窑沟农业生产合作社；1956-1957年改为瓦窑沟高级农业生产合作社；1958年改为南泉公社瓦窑沟管委会；1966-1976年称为瓦窑沟革命委员会；1977-1984年称瓦窑沟生产大队，属南泉公社；1984年到至今称为瓦窑沟村民委员会，属南泉乡。