明末，由洪洞县大槐树底下迁来居民。因地形四周高，中间洼，形象“窖子”，故取名“东窖”。

2023年11月，山西省爱国卫生运动委员会命名东窖村为2023-2025年山西省卫生村。

2020年8月，山西省爱国卫生运动委员会命名东窖村为2020—2022周期山西省卫生村。

东窖村是灵丘县东河南镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为140224101209，居民身份证号码前6位为140224。邮政编码为037000，长途电话区号为352 ，车牌号码为晋B。东窖村与北张庄村、南园村、亭之岭村、古之山村、大北地村、峰北村、清泥涧村、六合地村、三合地村、水涧村、燕家湾村、古树村、下野窝村、中野窝村相邻。历史沿革：1949年属东河南区，1958年属于古之河公社，1961年属于东河南公社，1984年镇社分社后属于东河南镇，设立东窖村民委员会。

2001年撤乡并镇后属于东河南镇。