原名“蜈蚣井”或说“竹林寺”、“草顶寺”。在春秋战国时番国庄子西侧，有一枯井，经常出现许多蜈蚣，人们捉来送给地方良医做药。庄名蜈蚣井。庄东有竹林，为祭祀，在竹林旁边盖一庙屋，庙屋上用草覆盖，得名竹林寺、草顶寺。南宋在草顶寺旁设急递铺（驿站），称草庙铺，沿至清。清初形成集市，更名草庙集。
固始县辖乡。1956年设草庙集乡，1958年改管理营，1959年设管理区，1961年建公社，1983年改乡。位于县境西南部，距县府16公里。面积为80平方公里，人口3万。淮商公路过境。辖广店、姜寨、皮岗、官田、沈堂、棠堆、草庙集、中心集、帐房、吕岗、仟佛、王岗12个村委会。农业主产水稻、小麦，兼产红麻、油菜子、花生。古迹有蒲草店龙山文化遗址。荣誉排行：
2012年12月，第七批河南省省级生态乡镇名单公布，草庙集镇上榜。
1949年建草庙、棠堆、仟佛、金店、瓦庙等小乡，属郭陆滩区。
1958年设草庙、金店管理片，属红旗（大）公社（驻郭陆滩）。
1959年改属汪棚（大）公社。
1961年建草庙、金店两个（小）公社，属汪棚区。
