清朝道光年间，有一包姓汉族人在此开车马店，接待过往商旅，群众习称包家店，故名。

2024年2月，包家店村被确定为2024年度新疆维吾尔自治区乡村振兴示范村建设名单。

2021年9月，包家店村被认定为第二批全国乡村治理示范村。

包家店村是玛纳斯县包家店镇下辖的行政村，城乡分类代码为121，为镇中心区。区划代码为652324102200，居民身份证号码前6位为652324。邮政编码为831100，长途电话区号为994 ，车牌号码为新B。包家店村与皇宫村、塔西河村、柴场村、油坊村、黑梁湾村、冬麦地村相邻。历史沿革：1958年包家店人民公社保林大队六队，1981年为包家店人民公社保林大队二队，1984年地名普查时命名为包家店村村民委员会，2001年本村委会进行了小村合大村合并上油坊庄，2018年合并保林社区，沿用至今。