祖上马氏，商纣骑兵官为姓，于明洪武皇策移民到此地居住，命名为马巷村。
2021年10月，农业农村部推介马巷村为2021年中国美丽休闲乡村。
2021年2月，马巷村被命名为2020年度甘肃省卫生村（社区）。
马巷村是东乡族自治县唐汪镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为622926104201，居民身份证号码前6位为622926。邮政编码为731100，长途电话区号为930 ，车牌号码为甘N。马巷村与张家村、舀水村、汪家社区、唐家社区、河沿村、照壁山村、塔石沟村、白咀村相邻。历史沿革：1958年隶属大树大公社，1960年为马巷大队，隶属于唐汪公社。
1983年成立唐汪乡人民政府，马巷大队改设马巷村民委员会至今。
