村庄在明清时期为的茶马古道，是重要的贸易中转站，当时还有一座建筑宏达的寺院，并且孔姓人氏居住较多，故名。
孔寺村是永靖县太极镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为622923102207，居民身份证号码前6位为622923。邮政编码为731100，长途电话区号为930 ，车牌号码为甘N。孔寺村与孔山村、白川村、四沟村、下古村、上古村、大川村、中庄村相邻。历史沿革：1959年，因盐锅峡水库蓄水，原村庄被淹没，村民搬迁后靠到现在的位置。
1961年为大川公社孔寺大队。
1964年大川、刘家峡两公社合并为刘家峡公社时，名称未变。
1983年公社改乡镇后改名为孔寺村村民委员会至今。
