因地处一条很深的山沟，故而得名深沟。

2024年3月，甘肃省爱国卫生运动委员会命名深沟村为2023年度甘肃省卫生村。

深沟村是文县刘家坪乡下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为621222205203，居民身份证号码前6位为621222。邮政编码为746000，长途电话区号为939 ，车牌号码为甘K。深沟村与关头村、刘家坪村、关口村相邻。历史沿革：1949年文县解放，1951年全县调整为6区46乡，属尚德区刘家坪乡辖。

1953年6月全县调整为9区70乡，属尚德丹堡区刘家坪乡。

1955年10月合并区、乡机构后，属丹堡区刘家坪乡。

1958年12月成立丹堡公社，为丹堡公社深沟大队。

1961年公社划小，为刘家坪公社深沟大队。

1983年刘家坪公社改为刘家坪乡，属刘家坪乡辖。

1984年4月深沟大队改为深沟村，村下建合作社。

1986年设立深沟村村民委员会+查看详细深沟村历史沿革>>