1965年马寨大队和永兴大队合并为吴庄大队，1966年又分开取名马寨村大队，改革开放后，公社改为乡，马寨大队改名为马寨村，故取名马寨村。

2024年3月，甘肃省爱国卫生运动委员会命名马寨村为2023年度甘肃省卫生村。

2021年12月，张掖市爱卫张掖命名马寨村为2021年张掖市卫生村。

马寨村是山丹县位奇镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为620725102208，居民身份证号码前6位为620725。邮政编码为734000，长途电话区号为936 ，车牌号码为甘G。马寨村与永兴村、张湾村、四坝村、孙家营村、暖泉村、高寨村、朱湾村、二十里堡村、柳荫村、十里堡村、芦堡村、东湾村、汪庄村、位奇村相邻。历史沿革：该村1958年叫做马寨农业生产合作社，下设12个生产小队，1962年体制下放叫做位奇人民公社马寨生产大队，管辖5个自然生产小队，1983年改名为马寨村委会。