因村庄地处一条山沟两侧，耕地土质肥沃，多为黑土地，故名。
黑沟村是武山县城关镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为620524100234，居民身份证号码前6位为620524。邮政编码为741000，长途电话区号为938 ，车牌号码为甘E。黑沟村与花坪村、黄山村、雷山村、令川社区、坪源村、坡儿社区、北山村、雷口村、西岔村、磨儿村、何沟村、南峪村、上沟村、杨坪村相邻。历史沿革：1949年至1986年期间为东顺乡所辖行政村，1986年8，将黑沟分设为黑沟和山坪两个行政村，隶属东顺乡。
2003年乡镇区划调整，撤销东顺乡，划归城关镇管辖。
2005年3月撤并村，将黑沟与山坪村合并，合并后的村为黑沟村，隶属城关镇至今。
