因地处以赵姓命名的沟渠附近而得名。
2024年3月，甘肃省爱国卫生运动委员会命名赵沟村为2023年度甘肃省卫生村。
赵沟村是永昌县水源镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为620321105208，居民身份证号码前6位为620321。邮政编码为737100，长途电话区号为935 ，车牌号码为甘C。赵沟村与新沟村、东沟村、西沟村、北地村、永宁村、方沟村、华家沟村、宋家沟村、胜利村、杜家寨村相邻。历史沿革：民国时属永宁乡七保。
1955年组建初级农业社，属永宁乡，1957年转为高级农业社。
1959年改为清河公社龚家堡大队赵沟生产队，1961年划为水源公社赵沟大队。
“文革”中改名前进大队，1970年恢复原名。
1983年政社分社后设村民委员会，属水源乡。
2000年11月，水源撤乡建镇，属水源镇至今。
