因古时沟内古木林立，枝繁叶茂，遮天如日，犹如烧木炭之黑窑故名。

2022年10月，黑窑沟村被列入第六批中国传统村落。

黑窑沟村是镇安县云盖寺镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为611025113219，居民身份证号码前6位为611025。邮政编码为711400，长途电话区号为914 ，车牌号码为陕H。黑窑沟村与西洞村、金钟村、东洞村、西华村、岩湾社区、云镇社区、花园社区相邻。文化旅游：

镇安刘氏民居镇安刘氏民居时代：清地点：镇安县云盖寺镇黑窑沟村保护范围：（1）东院：东至刘氏民居后檐以东30米，西至刘氏民居道场坎外30米，南至刘氏民居以南30米，北至刘氏民居以北30米；（2）西院：东至历史沿革：1958年公社化时属云镇公社。

1960年成立云镇公社塘园大队、明星大队，1984年改为云盖寺乡塘园村、明星村，1997年改为云盖寺镇塘园村、明星村，2001年改为云盖寺镇黑窑沟村，2002年塘元和明星合并并改名为云盖寺镇黑窑沟村，至今未变化。