此地有三个垭口，多生马桑树，并相传早年在此训的战马能跳三个垭口，故名。
2019年12月，马三垭村入选2019年四川省卫生村（社区）名单。
马三垭村是通江县麻石镇下辖的行政村，城乡分类代码为210，为乡中心区。区划代码为511921105213，居民身份证号码前6位为511921。邮政编码为636700，长途电话区号为827 ，车牌号码为川Y。马三垭村与红梁村、云昙村、蒲家坪村、印顶寨村、土顶子村、双柏树村、瓦尖山村、高石梯村、长清村、禹王宫社区相邻。历史沿革：1976年前叫三合公社前进村，1976年后取名三合公社马三垭村，2020年5月乡镇行政区划调整，设麻石镇马三垭村，沿用至今。
