此地有雍正年间柴姓族人修建的宗祠，故名。

2021年1月，柴氏祠村入选2020年四川省卫生村（社区）名单。

柴氏祠村是南部县花罐镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为511321123225，居民身份证号码前6位为511321。邮政编码为637300，长途电话区号为817 ，车牌号码为川R。柴氏祠村与曲家桥村、冯家岩村、马跑泉村、柳驿场社区、桅杆坝村、福寿亭村、火石坪村、凡水寺村、梁家坝村、小分庙村、雨台山社区相邻。历史沿革：1950年，隶属柳驿乡。

1961年，隶属柳驿公社（人民公社运动），为11大队。

1980年，隶属柳驿公社，更名为柴氏祠大队（一普避重名）。

1984年，隶属柳驿乡，更名为柴氏祠村。

1991年，隶属花罐镇（撤乡并镇）。

1994年，隶属柳驿乡（乡镇建制调整）。

2020年，村级建制调整，撤销柴氏祠村、洞空湾村、左家庵村，设立柴氏祠村（南府函〔2020〕38号）。