以境内慈云寺得名，慈云寺始建于唐代，取“佛之仁慈之心如大云覆盖众生”之意。
2022年12月，慈云村上榜重庆市第四批美丽宜居乡村。
慈云村是重庆市高新区走马镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为500107106209，居民身份证号码前6位为500107。邮政编码为400000，长途电话区号为023 ，车牌号码为渝。慈云村与乐园村、大石村、梓桐村、椒园村、金马村、玉龙村、石桥村、银岗村、灯塔村、关武庙社区相邻。历史沿革：1949年前属巴县走马乡第6保。
2001年将工农村并入组建慈云村村民委员会至今。
