1958年公社化时，该大队由水尾和澄塘两个小乡各取首字组成新地名，故名。
2019年9月，水澄村上榜2018年广东省“民主法治示范村（社区）”创建单位名单。
水澄村是紫金县紫城镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为441621100207，居民身份证号码前6位为441621。邮政编码为517499，长途电话区号为762 ，车牌号码为粤P。水澄村与黄花村、衙前村、中埔村、横径村、中洞村、新庄村、蓝坑村、上庄村、鹧鸪村、林田村、城西村、璜光村、白溪村、璜坑村相邻。历史沿革：1958年属附城公社水澄大队，1961年属黄花公社水尾、澄塘大队，1963年属附城公社水澄大队，1983年属附城区水澄乡，1987年属附城乡水澄村委会，1989年改为水澄管理区，1999年属附城镇水澄村委会，2009年7月属紫城镇，沿用至今。
