此地原是荒无人烟的茅草地，圪针棵横生。明末，孙氏家族迁来此地定居，因长满了圪针，村人都姓孙，故称孙圪针园，1967年，报经地县有关部门批准，又改为孙吉元。
2022年1月，孙吉元村被命名定为2021年度河南省卫生村。
孙吉元村是鹿邑县贾滩镇下辖的行政村，城乡分类代码为220，为村庄。区划代码为411628108211，居民身份证号码前6位为411628。邮政编码为466000，长途电话区号为394 ，车牌号码为豫P。孙吉元村与高庄村、谢庄村、梁庄村、五门村、任堂村、后堂村、后狄楼村、周庄村、李老村、双庙村、凌堂村、谷楼村、薛庄村、大宋村相邻。历史沿革：1947年属马铺区。
1958年为贾滩人民公社孙吉元大队。
1983年改称孙吉元村民委员会，属贾滩乡。
2013年改为孙吉园村民委员会，属贾滩镇至今。
